卫福部推动大肠癌公费筛检政策，符合资格民众如检出粪便潜血阳性，后续需接受大肠镜检查，部分民众检出大肠癌或大肠息肉，需手术切除。台湾内视镜医学会理事长邱瀚模指出，许多医师建议切除大肠息肉病人年年回诊追踪，但按照指引，如非高风险病人，回诊频率不必如此高，反复劝说病人接受过度频繁检查，不仅增加经济负担、焦虑与不必要风险，也排挤真正需要内视镜的病人。

邱瀚模指出，近期常见医师在社群上发文，建议民众每年都应接受大肠镜检查，然而，根据全球指引及共识，除非大肠镜检查后发现有3颗以上的腺瘤性息肉，或息肉大小超过1公分，才需提高检查密度，多数病人5年甚至7年追踪一次即可，为此，他担任主任的台大医院健康管理中心，已将大肠镜检查从年度健检套组中移除，改为由病人自行选择加做，「留在套餐中并不合理。」

台大公卫学院教授陈秀熙指出，卫福部健保署、国健署均依照欧美作法提出大肠癌息肉切除指引，依风险区分决定检验频率，且我国有独步全球，以大肠息肉切除颗数计费的健保给付机制，应可杜绝多数过度检查、治疗情况，而大肠息肉与粪便潜血浓度有关，目前粪便潜血检查结果民众仅会知道阳性、阴性，但政府已在研拟针对不同粪便潜血浓度，订出不同筛检频率的政策方向。

土城医院副院长苏铭尧指出，若大肠息肉病理报告显示为腺性息肉，依息肉数量、大小判定追踪频率，如大于一公分且数目低于三科，表示病人体质易长息肉、大肠癌风险较高，建议1至3年追踪一次；若息肉小于1公分、数量小于3颗，可3至5年追踪一次。

如病理报告显示为为非腺性息肉，而是随年龄增长自然产生的增生性息肉，则不必定期做大肠镜检查，可按照常规接受大肠癌筛检，以粪便潜血检查，如出现异常再进行后续处置。